Maduración de afinidad asistida por computadora

La maduración de afinidad asistida por computadora (CAAM) es un proceso que utiliza herramientas computacionales para optimizar la afinidad y especificidad de los nanocuerpos a través de la evolución dirigida.

El proceso de CAAM por lo general involucra los siguientes pasos:

Análisis de secuencias
Se analiza la secuencia de aminoácidos del nanocuerpo para identificar posibles regiones para la mutación. Este análisis puede incluir la identificación de residuos de aminoácidos que están en contacto con el antígeno objetivo y regiones del anticuerpo que podrían ser mutadas sin alterar la estructura y función general del anticuerpo.

Modelado in silico
Se utilizan herramientas computacionales para predecir las propiedades estructurales y funcionales del nanocuerpo mutado. Esto puede implicar el uso de simulaciones de dinámica molecular para predecir los efectos de las mutaciones en la estructura y estabilidad del anticuerpo, o el uso de simulaciones de acoplamiento computacional para predecir la afinidad de unión del anticuerpo mutado al antígeno objetivo.

Diseño racional
Basado en el análisis de secuencias y en el modelado in silico, se diseñan mutaciones que probablemente mejoren la afinidad y especificidad del anticuerpo al antígeno objetivo. Estas mutaciones pueden implicar cambios en los residuos de aminoácidos que están en contacto con el antígeno objetivo o cambios en la estructura del anticuerpo para mejorar sus propiedades de unión.

Validación
El nanocuerpo mutado se valida a través de métodos experimentales para asegurar que tenga la especificidad y afinidad de unión deseada al antígeno objetivo, así como una mayor estabilidad y una menor inmunogenicidad.

Optimización
El nanocuerpo mutado puede ser optimizado aún más a través de rondas adicionales de maduración de afinidad, utilizando la modelización computacional iterativa y la validación experimental.

En general, la CAAM ofrece una herramienta poderosa para optimizar la afinidad y especificidad de los nanocuerpos, lo que permite la creación de anticuerpos de alta calidad para una variedad de aplicaciones. Contáctenos hoy mismo para obtener más información sobre nuestro servicio de maduración de afinidad asistido por computadora y cómo podemos apoyar sus necesidades de investigación.